76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3224 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  56.25 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  55.21 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  44.09 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  46.07 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  38.95 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  39.8 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  40.62 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  39.77 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  38.2 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  42.39 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.66 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  32.35 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.87 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.17 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  29.79 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.55 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  30.53 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  31.96 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  29.27 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  28.57 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  28.57 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  26.47 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  29.76 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  32.65 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  27.37 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  23.4 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  33.66 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0815  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000215644  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  29.03 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  27.16 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  28.57 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  29.79 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  29.35 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  29.76 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  29.59 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  29.9 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  44.68 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  32.56 
 
 		 93 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>