88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2563 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  62.24 
 
 
100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  61.22 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 
100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  62.38 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  61.22 
 
 
100 aa  123  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  57.14 
 
 
103 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  60.2 
 
 
100 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  58.59 
 
 
102 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  60 
 
 
104 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  57.14 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.75 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.18 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  47.89 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  47.89 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  37.76 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  42.7 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  35.64 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  43.01 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  37.08 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  40.66 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  39.18 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  33.67 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  34.02 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  33.71 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  34.38 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 
100 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  32.39 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  40.43 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.37 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  33.8 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  39.77 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.85 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  38.2 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  36.17 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.87 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  25.81 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  52.63 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  40 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  40 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.91 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  37.89 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  36.99 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.71 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  45.28 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.92 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.42 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  33.8 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  40.23 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25.58 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  36.17 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 
92 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  39.13 
 
 
94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  34.44 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.11 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  31.25 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  39.13 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
107 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  31.18 
 
 
94 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>