42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1796 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
97 aa  200  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  98.97 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  97.94 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.67 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  47.96 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  45.92 
 
 
101 aa  87.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  46.94 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  41.49 
 
 
96 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  37.76 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  38.89 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  41.41 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  37.65 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  37.11 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  50 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  35.87 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  39.18 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  42.67 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  34.74 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  40.74 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  38.14 
 
 
103 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  35.64 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  32.76 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  33.66 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.84 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  32.63 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  26.32 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  34.33 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  32.84 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  28.95 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  41.18 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>