41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1444 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  200  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  98.97 
 
 		 97 aa  199  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  97.94 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.73 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  47.96 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  45.92 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  46.94 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  42.55 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  39.8 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  39.78 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  42.42 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  38.82 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.96 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  39.18 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  42.67 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  36.63 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  41.98 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  38.14 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  35.64 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  32.76 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.84 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  26.32 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  34.33 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  33.66 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  41.18 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>