60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2193 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  58.06 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  39.18 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.45 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  36.46 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  32.26 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  30.77 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0945  plasmid stabilization system protein  24.72 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.25 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  34.88 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  31.87 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  36.25 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.8 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.48 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0926  prophage LambdaSa04, RelE/ParE family protein  26.32 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.95 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  32 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  36.54 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.58 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  32.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  29.58 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  31.11 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  32 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  28.77 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.93 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  28.89 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  32.1 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.66 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0357  plasmid stabilization system protein  21.69 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00455292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1356  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  21.18 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.950978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.58 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  28.77 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  30 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>