31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1695 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  100 
 
 		 93 aa  183  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  42.22 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  34.74 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.16 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  28.57 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  32.98 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  31.87 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  35.56 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  36.84 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  32.97 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.44 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  36.56 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  32.89 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.89 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.62 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  35.14 
 
 		 110 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>