59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0575 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  208  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  66.34 
 
 
104 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  54.74 
 
 
96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  41.94 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  45.16 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  45.16 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  44.3 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.82 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  42.22 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.46 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.71 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 
100 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  30.1 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  32.61 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  32.47 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  32.47 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  29.7 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31.46 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  33.71 
 
 
98 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  30.53 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  31.52 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  35.37 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.61 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  30.61 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.11 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  30.43 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  31.87 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2487  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000234328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  32.05 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.57 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  35.14 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  32.67 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  31 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  31.63 
 
 
94 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 
102 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  32.04 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  31 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  28.43 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  30.95 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  31.58 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  35.05 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 
109 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>