50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3457 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  100 
 
 		 112 aa  233  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.49 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 98 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.43 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.43 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  38.3 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2087  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  29.47 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  34.44 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  26.32 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  30.69 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6368  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.718684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  32.61 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  27.17 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  27.17 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  27.66 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  31.82 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  34.83 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  27.47 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3831  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  30 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  27.08 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  29.07 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  27.96 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  24.44 
 
 		 96 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  30 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>