32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0332 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  207  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  92.93 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  92.93 
 
 		 99 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  69.7 
 
 		 111 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  33.68 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.37 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  28.72 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  30.21 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2850  plasmid stabilization system protein  33.73 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0251697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  32.56 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  29.03 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  23.4 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  30.88 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  31.18 
 
 		 99 aa  43.9  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  27.71 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  26.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  27.78 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>