48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0937 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  230  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  70.71 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  69.7 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  69.7 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  36.46 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  34 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.02 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  30.3 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  34.88 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  28 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.53 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.55 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  27.72 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0699  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.471948  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  29.21 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  27.37 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  30 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  27.37 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  25.29 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  28.89 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5297  plasmid stabilization system  25.93 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  23.81 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  29.59 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  26.37 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4215  plasmid stabilization system protein  26.6 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  25.49 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>