37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2746 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  79.28 
 
 		 111 aa  182  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  35.48 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  34.41 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  34.04 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0978  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  35.71 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  26.8 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  28.87 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  26.88 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2374  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1151  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1629  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680479  normal  0.322484 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  30.21 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3113  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3160  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3694  plasmid stabilization system protein  23.4 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0332  plasmid stabilization system protein  23.4 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0428  plasmid stabilization system protein  22.34 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  34.72 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  31.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  37.18 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3750  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1148  hypothetical protein  35.19 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>