58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1116 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  100 
 
 
98 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  63.92 
 
 
102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  47.25 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  43.75 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  40 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.86 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  44.19 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  42.71 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  44.3 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.01 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  36.56 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  42.27 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  37.63 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  38.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.96 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.62 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  38.96 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  35.16 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  37.23 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.89 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  38.46 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  34.74 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  41.77 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  39.18 
 
 
93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.98 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  36.46 
 
 
101 aa  48.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  34.78 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  46.43 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.41 
 
 
98 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  39.13 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  29.67 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  37.23 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  36.26 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  30.43 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2376  hypothetical protein  35.37 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  32.35 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>