23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_60050  putative plasmid stablization protein  100 
 
 		 116 aa  237  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000021957  hitchhiker  0.00000000520771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4525  plasmid stablization protein  91.3 
 
 		 119 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3062  plasmid stabilization system protein  57.39 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3723  plasmid stabilization system  45.69 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000315563  normal  0.426488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0286  plasmid stabilization system  30.63 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  26.09 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  28.7 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2982  hypothetical protein  60.61 
 
 		 45 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.521363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  28.44 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  32.11 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  25.22 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  25.86 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11987  hypothetical protein  27.68 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  26.55 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  25.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  27.03 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  26.36 
 
 		 99 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  30.09 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  30.56 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  25.69 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  28.32 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6084  plasmid stabilization system protein  33.94 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>