42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1059 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  100 
 
 		 93 aa  190  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  33.73 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  31.11 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  34.44 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  35.16 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  26.97 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  27.78 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  32.43 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  29.55 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  32.5 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  26.67 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  34.94 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  25.56 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  28.74 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  31.33 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  36.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  25.58 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  30.49 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  30 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  25.84 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  23.75 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 106 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>