32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0252 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  63.54 
 
 
96 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  47.96 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  45.83 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  43.16 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  44.83 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  39.78 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  39.33 
 
 
98 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  42.11 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  34.41 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  37.23 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  40.91 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  34.41 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  37.36 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  30.53 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  33.71 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  34.74 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  35.96 
 
 
99 aa  57  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.89 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  37.36 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  31.25 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  25.29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1185  plasmid stabilization system  31.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000764617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  41.51 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  26.09 
 
 
103 aa  42  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  27.27 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>