34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1848 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  204  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  50 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  35.05 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  33.68 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  34.41 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  35.11 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  30.43 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  28.42 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  26.04 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  29.07 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  27.84 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  26.32 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  31.82 
 
 
101 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  30.21 
 
 
101 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  26.04 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  31.18 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  26.97 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  26.32 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  29.67 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  24.21 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  34.38 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  31.4 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  30.86 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  27.37 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  30.95 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  26.32 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  28.74 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  32.31 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  28.99 
 
 
113 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  24.64 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>