35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0352 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 104 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  42.55 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  35.87 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  38.95 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  42.27 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  42.11 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  38.71 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  34.69 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  36.05 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  37.93 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  25.26 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  35.53 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  40.3 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  34.48 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  27.78 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  34.38 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  26.53 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  30.77 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  26.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  26.92 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>