37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4021 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
98 aa  205  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  45.26 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  41.24 
 
 
125 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  41.05 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  38.78 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  39 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  42.71 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  38.95 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  37.89 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  36.96 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  37.5 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.69 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  37.76 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  34.74 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  31.03 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  33.8 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  38.81 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  31.63 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  27.37 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  30 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  28.74 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  29.03 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  30 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  27.38 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  28.42 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  28.42 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  35.38 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  30.16 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0239  hypothetical protein  43.9 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.781441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  24.21 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  26.67 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>