16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  199  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  55.56 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  47.42 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  54.84 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  44.9 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  46.59 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2895  hypothetical protein  43.64 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  33.8 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 95 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  26.67 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  24.44 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>