41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1938 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  43.62 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  37.89 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  34.88 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  34.94 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  30.59 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  34.62 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  36.9 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  40.22 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  36.76 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  32.47 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  31.4 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.15 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  36.9 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  33.85 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  25.61 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  27.63 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  26.44 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  30.95 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  36.14 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  27.63 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  28.24 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  38.55 
 
 		 99 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  25.61 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2885  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12172  hypothetical protein  33.78 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  25.97 
 
 		 95 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>