24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1934 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  193  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  52.63 
 
 
96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  54.64 
 
 
100 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  52.63 
 
 
99 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  51.55 
 
 
99 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  47.42 
 
 
98 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  47.31 
 
 
103 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  42.71 
 
 
99 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  34.65 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2895  hypothetical protein  42.86 
 
 
57 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  34.78 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  31.63 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  35 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  29.17 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  25.26 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  28.89 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  27.17 
 
 
98 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  28.12 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  29.52 
 
 
107 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>