16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2634 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  65.98 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  58.76 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  56.57 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  54.64 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  51.55 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  47.92 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2895  hypothetical protein  38.6 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  25.77 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  34.92 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  28.12 
 
 		 98 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>