45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00614 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  100 
 
 		 98 aa  203  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  38.14 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  39.78 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  35.05 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  36.56 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  31.63 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  34.04 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  32.29 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  32.98 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  35.05 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  36.67 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  33.67 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  33.82 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  31.76 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  28.74 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  27.08 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  30.59 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  26.88 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  26.32 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  24.74 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  28.12 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0305  hypothetical protein  37.25 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  28.99 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  25.77 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  28.21 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.77 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  34.92 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2529  hypothetical protein  30.61 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1185  plasmid stabilization system  26.74 
 
 		 107 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000764617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>