40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2727 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  223  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  47.52 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  36.56 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  40.86 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  34.04 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  29.07 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  30.11 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  36.05 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  29.79 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  31.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  25.26 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  28.26 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  32.31 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  32.56 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  27.84 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  29.59 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  25.27 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0305  hypothetical protein  39.22 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2529  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>