20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2256 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  237  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  65 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  38.81 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  34.67 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  38.24 
 
 
99 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  40.3 
 
 
104 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  37.31 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  29.85 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.21 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  32.31 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  37.5 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  28.21 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  28.99 
 
 
98 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  30.43 
 
 
98 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  23.75 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>