32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1322 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  47.52 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  45.26 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  42 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  40.21 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  35.05 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  32.98 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  32.99 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  38.16 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  31.03 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  28.42 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  34.44 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  28.41 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.29 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  23.71 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  26.44 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  22.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.781441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  23.4 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>