33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2071 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  100 
 
 		 97 aa  201  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 96 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  41.11 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  35.05 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  36.26 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  37.36 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  31.11 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  37.36 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  36.08 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  35.23 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  34.38 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  32.63 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  31.52 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  31.11 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  34.15 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.07 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  31.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  28.92 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  26.21 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  26.44 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>