36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1130 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  203  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  65.96 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  38.78 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  36.84 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  43.16 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  34.78 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  40.82 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  40.91 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  38.64 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  32.29 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.98 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  29.07 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0136  hypothetical protein  39.68 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.45293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  25.77 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  29.89 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  31.25 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  31.58 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2255  hypothetical protein  54.84 
 
 		 31 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000875059  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  33.73 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  27.69 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  31.4 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  27.16 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  26.67 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>