31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4758 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  100 
 
 
96 aa  199  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  46.94 
 
 
96 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  45.83 
 
 
96 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  36.96 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  42.86 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  38.78 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  33.68 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  32.61 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  34.04 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  38.95 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  32.14 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  28.26 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  28.42 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  29.79 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  32.29 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  30.53 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  32.63 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  27.47 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  26.8 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  29.17 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  32.43 
 
 
93 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  27.55 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  27.08 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  22.99 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>