19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2271 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  52.63 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  52.63 
 
 
99 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  54.64 
 
 
99 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  52.13 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  45.36 
 
 
99 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  46.59 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  32.22 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.61 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  32.56 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  29.35 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2895  hypothetical protein  38.18 
 
 
57 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  27.08 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  28.12 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.03 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
97 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>