32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0707 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  28.89 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  35.56 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  31.52 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  31.96 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  34.02 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  29.55 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  26.04 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  29.89 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  26.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  36.25 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  34.48 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  32.97 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  25.77 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  29.21 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  29.29 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  32.97 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  29.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  29.67 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  31.94 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  36 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  29.07 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  29.03 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>