36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0279 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  100 
 
 		 100 aa  204  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  42.71 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  41.76 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  40.66 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  31.91 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  31.11 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  32.99 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  34.69 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  35.05 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  34.21 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  26.32 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  30.43 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.83 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  29.21 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  27.72 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  27.63 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  30.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  27.37 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>