34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1752 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  39 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  37.5 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  34.69 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  39.18 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  37.93 
 
 		 98 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  32.29 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  40.86 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  30.11 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  29 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  37.93 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  26.32 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  32.22 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  28.41 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  29.85 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  31.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  24.74 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  46.34 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  34.38 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  27.96 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  32.84 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1185  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 107 aa  41.2  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000764617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>