36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0273 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  37.89 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  57  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  31.63 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  34.21 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  35.16 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  31.63 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  30.95 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  28.26 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  25.56 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  29.76 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  30.3 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  30.53 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  29.27 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  27.84 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.59 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  26.19 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>