45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1571 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  100 
 
 
100 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  42.27 
 
 
98 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  35.05 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  36.17 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  35.96 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  35.11 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  39.78 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  37.36 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  34.41 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  35.16 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  37.5 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  37.21 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  33.67 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  34.65 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  30.61 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  32.98 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  36.05 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  30.11 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  32.22 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  33 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  32.22 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  31.25 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  29 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  29.29 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  30.43 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  32.61 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  35.44 
 
 
97 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  29.17 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  31.68 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  29.17 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  30 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  32.18 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  27.96 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1814  plasmid stabilization system  27.96 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000102584  decreased coverage  0.0000000000874198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1185  plasmid stabilization system  25.51 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000764617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  32.65 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  28.09 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  25.77 
 
 
99 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  24.44 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  28.21 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1444  hypothetical protein  55.26 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  32.94 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  25.53 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>