34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1113 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  100 
 
 		 125 aa  259  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0714  hypothetical protein  44.33 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  43.16 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  41.24 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  43.16 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  41.49 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  40.86 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  40.43 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  39.18 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  38.54 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2071  plasmid stabilization system protein protein  37.36 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  33.68 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  33.71 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2256  hypothetical protein  37.31 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144903  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.65 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  28.87 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0989  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  32.35 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  26.32 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  32.47 
 
 		 97 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  25.25 
 
 		 103 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>