21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2399 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
97 aa  196  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  33.68 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  33.68 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  31.91 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  30.61 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  37.36 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  30.53 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  30.68 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1185  plasmid stabilization system  31.63 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000764617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  22.83 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  25 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  30.85 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0364  hypothetical protein  26.67 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000114532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  26.6 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  36.99 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>