23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4655 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  39.78 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  30.86 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  32.22 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  31.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0707  hypothetical protein  29.41 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  31.08 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  31.82 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  31.58 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1444  hypothetical protein  43.75 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 104 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>