22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1389 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  76.09 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2885  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  28.12 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  31.87 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  25.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  28.09 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0496  hypothetical protein  26.6 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000135473  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  26.09 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  29.21 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1149  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2581  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  22.83 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  35.05 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 98 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>