32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0806 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  89.53 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  87.06 
 
 		 96 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  82.35 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  74.42 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  69.88 
 
 		 83 aa  117  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  38.82 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  38.82 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.9 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  42.35 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  37.8 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  39.02 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  39.02 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.17 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  40.48 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  32.93 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  32.56 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  31.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 91 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  26.74 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  38.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  34.94 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>