33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1389 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  92.93 
 
 		 99 aa  186  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  83.84 
 
 		 99 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 		 99 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  57.43 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  54.46 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  54.37 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  62.96 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  47.06 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  51.76 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  50 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  41.35 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  37.37 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  48.1 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  35.87 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  38.71 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  41.3 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  30 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  38.89 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  32.93 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  38.98 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>