23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5922 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  51.92 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  47.57 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  51.46 
 
 		 99 aa  84.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  47.12 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  45.95 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  46.15 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  44.12 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  44.23 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  40.2 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  38.46 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  46.67 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  46.03 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  39.58 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  42 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.46 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  36.56 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  39.8 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>