34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1344 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  92.93 
 
 		 99 aa  186  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  84.85 
 
 		 99 aa  154  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  59.41 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  55.45 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  49.02 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  60.49 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  51.76 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  51.46 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  44.57 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  43.27 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.75 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  35.19 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  44.79 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.48 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  42.71 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  42.11 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  34.83 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  38.14 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  40.68 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>