34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0503 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  94.67 
 
 		 75 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  46.94 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  45.92 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  45.92 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.06 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  46.94 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  49.49 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  47.96 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  43.88 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  45.92 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  37 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  39.36 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  38.54 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  40 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40.96 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  44.26 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  40.48 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  38.14 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  36.67 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  39.6 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  33.67 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  36.89 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  34.38 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  35.64 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  32.95 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  34.85 
 
 		 103 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>