More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2362 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2362  MMPL domain protein  100 
 
 		 773 aa  1448    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0878397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  27.42 
 
 		 713 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  32.57 
 
 		 712 aa  181  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.63 
 
 		 747 aa  180  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.43 
 
 		 723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  24.86 
 
 		 743 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.33 
 
 		 740 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  25.79 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  25.79 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  25.79 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.08 
 
 		 709 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  25.7 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  25.79 
 
 		 743 aa  162  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  30.15 
 
 		 699 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  25.79 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  25.93 
 
 		 743 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  28.07 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  24.63 
 
 		 743 aa  155  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  28.79 
 
 		 745 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.29 
 
 		 737 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  24.02 
 
 		 743 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  24.28 
 
 		 882 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  31.03 
 
 		 702 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  31.1 
 
 		 576 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 		 712 aa  145  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  29.53 
 
 		 719 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  28.83 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.87 
 
 		 832 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 726 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  26.49 
 
 		 743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.31 
 
 		 717 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  27.26 
 
 		 733 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  28.78 
 
 		 836 aa  134  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  29.77 
 
 		 699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.08 
 
 		 724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  27.13 
 
 		 974 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  31.11 
 
 		 682 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.38 
 
 		 710 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  31.45 
 
 		 701 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  29.19 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  30.15 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  30.21 
 
 		 674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  30.21 
 
 		 674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  29.59 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  30.02 
 
 		 674 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.3 
 
 		 974 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  28.38 
 
 		 699 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.12 
 
 		 981 aa  122  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.6 
 
 		 723 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.57 
 
 		 734 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  29.65 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  30.47 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  28.83 
 
 		 679 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  22.71 
 
 		 829 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  22.71 
 
 		 829 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  27.75 
 
 		 729 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  28.19 
 
 		 920 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.06 
 
 		 724 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  30.86 
 
 		 1077 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  27.61 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  31.05 
 
 		 764 aa  113  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  30.74 
 
 		 1146 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  28.18 
 
 		 779 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  26.17 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  28.73 
 
 		 761 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  31.27 
 
 		 727 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 1155 aa  111  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.6 
 
 		 697 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.37 
 
 		 752 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  28.68 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  28.45 
 
 		 732 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  29.61 
 
 		 729 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  33.73 
 
 		 726 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  29.63 
 
 		 741 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  25.52 
 
 		 781 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  27.45 
 
 		 770 aa  108  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  27.16 
 
 		 726 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  31.75 
 
 		 1054 aa  107  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  27.87 
 
 		 909 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 735 aa  107  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  26.16 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  28.63 
 
 		 1040 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  31.72 
 
 		 734 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  27.25 
 
 		 766 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  37.92 
 
 		 1013 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.45 
 
 		 735 aa  105  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.83 
 
 		 746 aa  105  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  26.83 
 
 		 702 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 731 aa  104  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  29.78 
 
 		 787 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  28.79 
 
 		 724 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 793 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  23.87 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  38.5 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 734 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  28.38 
 
 		 728 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  24.12 
 
 		 1013 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  25.88 
 
 		 735 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 738 aa  100  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  27.64 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>