287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3112 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  83.43 
 
 		 527 aa  892    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  68.94 
 
 		 523 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  100 
 
 		 527 aa  1072    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  67.86 
 
 		 522 aa  700    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  70.27 
 
 		 525 aa  760    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  67.67 
 
 		 530 aa  708    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  64.12 
 
 		 528 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  40.73 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  38.33 
 
 		 539 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  43.14 
 
 		 538 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  40.51 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  41.54 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  41.79 
 
 		 539 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  35.25 
 
 		 552 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  36.32 
 
 		 600 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  35.61 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 		 587 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  36.26 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  34.18 
 
 		 541 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  32.49 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  36.26 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  36.26 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  35.45 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  35.87 
 
 		 603 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  35.43 
 
 		 587 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  37.39 
 
 		 587 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  33.88 
 
 		 538 aa  279  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  37.81 
 
 		 563 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  34.01 
 
 		 576 aa  277  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 		 540 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  35 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  36.97 
 
 		 552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  36.97 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  36.97 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  36.97 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  41.51 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  38.39 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  36.75 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  36.97 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  39.64 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  38.54 
 
 		 519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  36.68 
 
 		 567 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  33.46 
 
 		 570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  37.11 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  38.48 
 
 		 539 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  33.15 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  34.53 
 
 		 540 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  35.11 
 
 		 594 aa  266  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  34.53 
 
 		 540 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1358  flagellar MS-ring protein  38.55 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  33.83 
 
 		 565 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  39.01 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  32.54 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  35.24 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  35.24 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  35.24 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  35.01 
 
 		 677 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 		 576 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  36.4 
 
 		 551 aa  263  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 		 579 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 		 579 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  34.74 
 
 		 579 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1891  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 569 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  36.52 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  34.95 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  37.56 
 
 		 541 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  37.12 
 
 		 562 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  32.14 
 
 		 512 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  38.67 
 
 		 590 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  35.74 
 
 		 566 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  33.46 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  34.78 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  32.62 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  36.8 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  36.8 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.19 
 
 		 561 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.64 
 
 		 538 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  33.64 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  35.81 
 
 		 584 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0218  flagellar M-ring protein FliF  32 
 
 		 574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  31.04 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  33.53 
 
 		 567 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  38.72 
 
 		 548 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  35.5 
 
 		 611 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  35.26 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.03 
 
 		 595 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  35.99 
 
 		 524 aa  251  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  38.78 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  37.99 
 
 		 567 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.39 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  32.14 
 
 		 529 aa  249  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2575  flagellar MS-ring protein  34.25 
 
 		 574 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.1097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>