198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2244 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  49.18 
 
 		 799 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  54.77 
 
 		 826 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  46.78 
 
 		 787 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  42.84 
 
 		 771 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  48.06 
 
 		 796 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  48.93 
 
 		 799 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  48.47 
 
 		 796 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  49.18 
 
 		 799 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  48.86 
 
 		 794 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  100 
 
 		 831 aa  1696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  48.28 
 
 		 790 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  43.35 
 
 		 771 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  52.17 
 
 		 809 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  59.9 
 
 		 821 aa  982    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  43.35 
 
 		 771 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  63.35 
 
 		 827 aa  998    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  56.96 
 
 		 808 aa  858    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  57.95 
 
 		 834 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  52.04 
 
 		 813 aa  803    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.62 
 
 		 771 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.62 
 
 		 771 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  48.02 
 
 		 793 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  62.39 
 
 		 808 aa  959    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  53.57 
 
 		 799 aa  859    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  43.49 
 
 		 771 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  47.54 
 
 		 795 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  60.81 
 
 		 821 aa  1004    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  58.07 
 
 		 813 aa  874    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  48.74 
 
 		 799 aa  742    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  43.87 
 
 		 767 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  48.91 
 
 		 784 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  43.35 
 
 		 771 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  51.91 
 
 		 813 aa  800    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  43.23 
 
 		 771 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  42.32 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  43.36 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  42.32 
 
 		 770 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  42.73 
 
 		 768 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  42.29 
 
 		 767 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  43.43 
 
 		 768 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  42.45 
 
 		 769 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  42.23 
 
 		 772 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  41.29 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  39.61 
 
 		 784 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  39.92 
 
 		 820 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  38.21 
 
 		 816 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  39.1 
 
 		 810 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  38.59 
 
 		 787 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  38.3 
 
 		 783 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  37.56 
 
 		 794 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  37.89 
 
 		 786 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  37.35 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  37.72 
 
 		 804 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  38.08 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  38.08 
 
 		 786 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  38.38 
 
 		 786 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  37.85 
 
 		 786 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  38.25 
 
 		 786 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  38.25 
 
 		 786 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  37.79 
 
 		 786 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  37.82 
 
 		 804 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  36.88 
 
 		 797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  37.11 
 
 		 799 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  27.26 
 
 		 799 aa  260  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.05 
 
 		 792 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  26.44 
 
 		 791 aa  259  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.67 
 
 		 790 aa  247  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  24.58 
 
 		 797 aa  247  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.4 
 
 		 796 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  24.87 
 
 		 808 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.18 
 
 		 830 aa  217  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.87 
 
 		 805 aa  190  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.87 
 
 		 805 aa  190  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.15 
 
 		 806 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.15 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.5 
 
 		 806 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.62 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.97 
 
 		 773 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.39 
 
 		 808 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.89 
 
 		 778 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.29 
 
 		 831 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.6 
 
 		 800 aa  94.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.42 
 
 		 1051 aa  94.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.95 
 
 		 803 aa  91.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.52 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.74 
 
 		 804 aa  85.9  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.56 
 
 		 779 aa  84  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.66 
 
 		 905 aa  81.3  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.05 
 
 		 755 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.84 
 
 		 811 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.92 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.35 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.61 
 
 		 869 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  20.99 
 
 		 694 aa  67.8  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  20.25 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.8 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  23.71 
 
 		 842 aa  66.6  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.79 
 
 		 861 aa  66.6  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.02 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>