248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2951 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  53.88 
 
 		 246 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  49.8 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  49.33 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  46.15 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  46.72 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  47.54 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  34.94 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  37 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0400  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  31.34 
 
 		 243 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.14 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  27.95 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  30.9 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.7 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1201  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00280103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  31 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1139  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.57 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  32.75 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  31.47 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.92 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.74 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.78 
 
 		 391 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  29.08 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  29.8 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  27.53 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  28.74 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.5 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  31.45 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.83 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.08 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  28.23 
 
 		 287 aa  98.6  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  30.59 
 
 		 288 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  27.94 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.33 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.5 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  28.05 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  29.27 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.31 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  28.16 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.34 
 
 		 280 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  26.34 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  27.82 
 
 		 287 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  28.51 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2616  putative transmembrane protein  26.94 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  27.27 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  28.25 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  27.38 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.41 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  29.52 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.27 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  26.05 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  28.7 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  24.51 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.53 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  27.64 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.96 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.49 
 
 		 288 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 289 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  26.97 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000151596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1864  putative transmembrane protein  26.72 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 282 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 282 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  28.11 
 
 		 279 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.53 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.16 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  30.04 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 325 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  27.6 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  28.31 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.7 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>