More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2008 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  67.75 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  68.24 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  65.23 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  66.67 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  62.75 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  61.07 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  62.63 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.14 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  41.1 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.16 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  38.78 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 		 849 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  37.29 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.76 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  38.6 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  37.5 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.53 
 
 		 844 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  36.21 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  35.83 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.21 
 
 		 845 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  36.71 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  36.3 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.72 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  35.64 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.99 
 
 		 844 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.13 
 
 		 856 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  37.59 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  36.3 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.82 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  35.83 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  34.2 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.21 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  39.37 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  39.37 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.47 
 
 		 1055 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.75 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.27 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  32.26 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  35.56 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  31.31 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.43 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  40.94 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  37.59 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  38.24 
 
 		 759 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  32.17 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  31.31 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  31.31 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  31.31 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  34.53 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.77 
 
 		 991 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.98 
 
 		 762 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  36.52 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  32.66 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  34.72 
 
 		 314 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  33.86 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 989 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  34.45 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  31.99 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  33.78 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.08 
 
 		 995 aa  178  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  34.54 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  39.76 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  33.78 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1238  preprotein translocase subunit SecF  34.01 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  30.69 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  34.33 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.1 
 
 		 846 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  34.01 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.71 
 
 		 858 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  36.79 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  31.47 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  31.47 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.11 
 
 		 844 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3865  preprotein translocase subunit SecF  32.11 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  37.92 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  38.29 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>