More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2792 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  88.41 
 
 		 72 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 72 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6741  putative transcriptional regulator  58 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0202746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 505 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  40.28 
 
 		 652 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  37.5 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.32 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  50.91 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  36.76 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04285  DNA-binding protein, putative  46.3 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 528 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  42.19 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 207 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  42.37 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.37 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 642 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>